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KAPA HyperChoice 定制設(shè)計探針--【默瑞生物】

發(fā)布時間: 2020-07-01  點擊次數(shù): 1798次

KAPA HyperChoice / KAPA HyperExplore 定制設(shè)計

KAPA HyperChoice探針支持高達(dá)200 Mb的人類基因組區(qū)域定制, KAPA HyperExplore探針支持高達(dá)200 Mb的非人類基因組或復(fù)雜區(qū)域的定制。羅氏久經(jīng)驗證的專有算法,加上我們在探針排布和設(shè)計領(lǐng)域近20年的經(jīng)驗積累,能幫您解鎖基因組困難區(qū)域。結(jié)合優(yōu)化的KAPA HyperCap工作流程V3.0,KAPA靶向富集探針可大大提高捕獲均一性,并減少有效識別基因組變異所需的測序數(shù)據(jù)量。

精益設(shè)計

高性能KAPA靶向富集探針,快速、高效地覆蓋目標(biāo)區(qū)域

• 依靠羅氏專有算法和久經(jīng)驗證的探針排布及設(shè)計,改善目標(biāo)覆蓋度,提高測序效率,使樣本數(shù)據(jù)利用合理化。

• 支持上傳基因名稱和bed文件,手動輸入基因組坐標(biāo),或從常用基因名列表中進行選擇。

羅氏設(shè)計專家在線指導(dǎo)和支持

• 有關(guān)您的特殊設(shè)計需求或非人類物種定制,羅氏專業(yè)設(shè)計團隊將為您提供專屬服務(wù)。我們的設(shè)計專家將傾聽您的需求, 以優(yōu)化您的探針設(shè)計和選擇。

僅需幾步,理想設(shè)計唾手可得

• 羅氏的專業(yè)設(shè)計能力、合理的高保真探針合成工藝、優(yōu)化的KAPA HyperCap工作流程,是您從次設(shè)計開始就能體驗到的高品質(zhì)產(chǎn)品與服務(wù)。

 

KAPA HyperChoice / KAPA HyperExplore 定制設(shè)計探針

• 使用KAPA高保真聚合酶合成,經(jīng)羅氏專有算法設(shè)計。

• 基于NGS方法的質(zhì)量控制體系,保證質(zhì)量穩(wěn)定。

• 更高的均一性和更低PCR重復(fù)率,達(dá)到更好的目標(biāo)區(qū)域覆蓋


圖1. 未經(jīng)優(yōu)化的KAPA靶向富集探針,性能已然優(yōu)于SeqCap EZ Prime探針。對比試驗中,兩種方法均依照各自的標(biāo)準(zhǔn)HyperCap Workflow操作指南,樣本使用coriell DNA。每個捕獲反應(yīng)混合8個DNA文庫,并根據(jù)panel大小在MiSeq系統(tǒng)上以2 x 100 bp測序。為了同等比較兩種不同技術(shù)的性能,HyperChoice Panel根據(jù)SeqCap EZ Neurodegenerative進行設(shè)計,但并沒有像SeqCap EZ panel那樣經(jīng)過優(yōu)化。結(jié)果表明,KAPA HyperChoice探針以更高的均一性和更好的目標(biāo)區(qū)域覆蓋度超出SeqCap EZ版本探針。 在NovaSeq6000系統(tǒng)測序,結(jié)果顯示出非常低的PCR重復(fù)率,高均一性(Fold80低)和高目標(biāo)區(qū)域覆蓋(≥30X堿基覆蓋率)。兩種設(shè)計均按照KAPA HyperCap Workflow v3.0,樣本為100 ng NA12891 DNA。數(shù)據(jù)指標(biāo)為6個重復(fù),單樣本捕獲的平均值

默瑞生物

默瑞(上海)生物科技有限公司,作為專業(yè)的生命科學(xué)產(chǎn)品推廣與服務(wù)商,以“創(chuàng)新,專業(yè),共贏”的理念,不斷強化服務(wù)體系,提升客戶體驗,以莫納生物產(chǎn)品為主線,結(jié)合國內(nèi)外優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品提供高標(biāo)準(zhǔn)完整解決方案,幫助科研客戶和生物技術(shù)企業(yè)高效創(chuàng)新,加速轉(zhuǎn)化,創(chuàng)造更多優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品,提升社會福祉,實現(xiàn)多方共贏。

默瑞生物創(chuàng)立以來,已經(jīng)陸續(xù)導(dǎo)入

TwistDx,Jackson,Immunostep,101Bio,enzymatics,AATBioquest,KAPABIOSYSTEMS,BioDynami,Echelon,ChromoTek,Nanocs,Biotechrabbit,LeeBiosolutions, magtivio等優(yōu)質(zhì)品牌,逐步培育成為專業(yè)用戶的選擇。

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